(记者高雅丽)草莓具有重要的经济价值和营养价值。现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生物种佛罗里达草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中科院昆明植物研究所研究员朱安丹深入剖析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关结果在线发表在《自然-植物》杂志上。
朱安丹说,由于草莓的系统发育分析涉及未知祖先、同源染色体交换和不完全谱系整理,八倍体草莓的二倍体祖先问题仍有争议。此外,八倍体草莓亚基因组在驯化过程中的同源偏向表达和转化模式尚不清楚。
本研究提出了一套适用于多倍体的ALLHiC迭代安装方法,并在染色体水平上构建了高质量的基因型草莓基因组。研究人员完成了八倍体草莓亚基因组的分离,并在此基础上利用不同的分析方法追溯了八倍体草莓的二倍体祖先。
研究结果纠正了国外学者在亚基因组分配上的错误,进一步证实了森林草莓和水稻沼泽草莓是八倍体草莓现存的二倍体祖先。研究还探讨了八倍体草莓在驯化过程中的同源偏倚表达分化,完成了基于空间四倍体方法的八倍体草莓静态和动态同源偏倚分析,鉴定出一些重要转录因子在驯化过程中存在表达偏倚。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41477-023-01473-2
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