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科学家揭开葡萄进化中的双重驯化和性状起源,推翻单一起源的传统理论

版块:科技头条   类型:普通   作者:科技资讯   查看:40   回复:0   获赞:0   时间:2023-06-02 05:13:38

来源:DeepTech深科技


“满筐圆实骊珠滑,入口甘香冰玉寒”,元代诗人邓文原曾在七言绝句《题温日观葡萄》中这样描写葡萄。在每年夏秋之际,品尝已处于成熟期的、看起来饱满晶莹的葡萄,我们总能获得酸甜可口、消夏解暑的滋味。

科学家揭开葡萄进化中的双重驯化和性状起源,推翻单一起源的传统理论

(来源:Pixabay)

葡萄作为一种重要的水果作物,拥有非常悠久的历史。自人类有种植活动开始,就出现了关于葡萄各种各样的历史记载。


一般来说,野生葡萄的颗粒较小,产量不高,尝起来也很涩。而如今我们在市场上购买的各类葡萄,其果实颗粒却普遍比野生葡萄大,吃起来也很甜。那些用于酿酒的葡萄,甜度还会更高。


那么,人类究竟是如何将葡萄从野生的状态,逐步转变到我们今天所看到的样子?这个转变是在什么时间和地点发生的?它内在的遗传基础又是什么?


此前,相关领域的科学家们也对这些问题进行过研究,但得到的结论却天差地别。关于葡萄的最早驯化地点,就存在西亚、南高加索、伊比利亚半岛等多种说法;关于葡萄的驯化时间,也有距今 12000 至 10000 年间,以及 15000 年甚至 400000 年间等不同的观点存在。


近期,云南农业大学团队联合来自 17 个国家和地区的 89 位合作者,完成了一项大型国际合作项目。他们基于群体遗传学的分析方法,对全世界范围内 3525 份栽培和野生葡萄品种的葡萄进化和驯化历史进行了研究。


在该研究中,他们推翻了“葡萄只经历了一次驯化过程”的预先设定,发现如今的葡萄是由两次驯化过程得来的。


从时间上看,这两次驯化几乎处于同一个时间段,即距今约 11000 年前的农业起源时期;从地理位置上看,这两次驯化分别发生在西亚和高加索这两个不同的地理位置,相隔 1500 至 1600 公里。

科学家揭开葡萄进化中的双重驯化和性状起源,推翻单一起源的传统理论

图丨葡萄在西亚和高加索地区的双重驯化(来源:Science)

云南农业大学董扬博士、硕士研究生段胜常和硕士研究生董笑,深圳华大基因科技有限公司夏秋菊博士,以及中国科学院植物研究所梁振昌研究员为该论文的共同第一作者。云南农业大学陈玮博士、盛军博士,以及中国科学院植物研究所李绍华研究员担任论文的共同通讯作者。

科学家揭开葡萄进化中的双重驯化和性状起源,推翻单一起源的传统理论

图丨Science 当期封面(来源:Science)

该团队最早从 2017 年开始研究葡萄的遗传多样性,基于对 472 份葡萄品种的研究,于 2019 年在 Nature Communications 上发表了论文[2],并从中引出了许多有待解决的问题。


“当时我们就在想,如果能有更大的样本,我们就可以做一个非常激动人心的课题,回答有关葡萄驯化历史的、几乎近半个世纪都悬而未决的系列问题。”陈玮说。


于是,该团队开始邀请欧洲的合作者们参与这个合作项目。“合作者们不仅十分乐意,还充分发挥了他们各自的人际关系优势,联系更多的合作者们参与到该项目中。”陈玮说。


2019 年 8 月,在该团队成员被完全确定下来之后,合作者们便开始各尽所能,寻找世界范围内所有品种的野生葡萄和栽培葡萄,并将样品以干葡萄叶的形式寄到云南农业大学。


陈玮和所在团队的成员收到样品,就开始进行 DNA 提取、测序以及数据分析工作。


经过三年的努力和坚持,他们最终克服了所有问题,收获了扎实全面的科研结果,并得到了三位审稿人的一致好评。


谈及本次国际合作的心得体会,陈玮表示:“只有合作才能共赢。研究者们通过汇总各自的资源与发挥各自的专长,回答或解决困扰科学界良久的课题,并在学术界取得卓著的成就。”


据陈玮介绍,在这次国际合作中,他们积累了很多葡萄的资源。这不仅有利于更好地解释葡萄的驯化历史,还能促进培育新的葡萄品种,使其能够更加适应气候的不断变化、增强抵抗病虫害的能力。


目前该团队得到的研究结论,还是基于现有的葡萄品种和能够找到的样品。由于作物驯化是一个漫长的过程,接下来他们计划和国际合作者继续找到距离现在时间更远的样品,通过古 DNA 的研究手段探寻它们的遗传特征,并尝试发现那些已经被历史湮灭的细节。


参考资料:


1.Dong,Y., Duan,S., Xia,Q. et al. Dual domestications and origin of traits in grapevine evolution. Science 379, 6635, 892-901 (2023). https://www.science.org/doi/10.1126/science.add8655


2. Liang, Z., Duan, S., Sheng, J. et al. Whole-genome resequencing of 472 Vitis accessions for grapevine diversity and demographic history analyses. Nature Communications 10, 1190 (2019). https://doi.org/10.1038/s41467-019-09135-8


运营/排版:何晨龙

 
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